结局：当与莉莉丝结合后的巨型凌波丽出现后，立即打破了9台量产型EVA的反生物立场，并与真治的内心接触，恐惧且无助(曾向明日香求助却遭拒绝，并对明日香做了些不雅的事）的真治回到了童年的记忆-------孤单，没人了解（没有被父亲认可，出生就连母亲都没见过）。 童年的悲惨，扭曲的情感使真治想报复每一个人。 绫波问真治一个愿望（同时用肉体安抚了真治），真治（人类是毁灭还是进步此时命运就掌握在真治的手上）：“都去死吧”。

地球上的人们的躯壳融化了变成黄色的水，灵魂却融合在一起，抛弃了躯壳的人类以更高级的形式存在。 绫波牺牲自己，用血与肉体汇聚了一个红色的小星球（作用应该是诺亚方舟吧），人类并未灭亡--------明日香与真治活在这孤单的星球上。