修建颐和园确实挪用了部分海军军费，具体数额不详，大约在400万两之下。 不过最重要的是，修建颐和园的巨额开支对清政府的财政造成了巨大的压力，这也影响了清政府对海军的投入。

颐和园修复工程正式公布于于1888年，不过其实之前就已经开始。 1891年慈禧入住颐和园，不过工程并未结束，一直断断续续在进行，因此其到底耗资多少，目前也没有一个定论。

梁启超在他的著作《瓜分危言》中提到，马江战败以后，清政府筹集了3000万两海军军费，但是最后全部用于修复颐和园。 而太监王世和在《造陶庐日录》也提到修复颐和园耗资3000万两。 这以后就成了慈禧挪用3000万两海军款用于修复颐和园的主要证据。

不过需要注意的是，梁启超的说法仅仅源自他个人，实际上所谓马江海战后筹集的3000万两海军军费并不存在。 而海军衙门的资料虽然大多在战乱中损毁，不过按照它成立以后一年收款大约在3、400万两左右，再扣除调拨给南北洋水师和东北练兵所用款项，实际余款不多，显然也不大可能再拼凑出3000万两的巨资，因此也不可能挪用这么大一笔钱用于颐和园。

实际上根据姜鸣先生的考证，海军衙门陆续挪用于颐和园修建工程的款项大约在400万两左右，由于海军衙门经费并非全部是海军军费，因此挪用了多少海军军费尚且存疑。 此外还有以海防捐名义，实则为修园工程款的有357.7万两。 这笔钱严格说也不是给海军的，只是借个名义而已，因此不能算挪用海军军费。

因此如果只是说挪用海军军费，那么挪用的数额肯定不到400万两。

但是修建颐和园耗资巨大，而清政府的财政采取的是量入为出政策，一旦户部资金紧缺，就只能砍掉一些开支。 所以翁同龢迫于财政压力，提出了两年不外购军火的建议，这无疑极大的影响了北洋水师的战备情况。

因此修建颐和园实际对北洋水师造成的影响，并不局限于挪用了多少海军军费，还要看这对海军军费的筹集造成了多大的影响，这个就很难估量了。