忽必烈能够顺利击败阿里不哥，夺取汗位，东道诸王出了大力。 因为当时蒙古大汗必须得有忽里台大会推选才合法，而忽里台大会又必须得在漠北怯绿连河一带举办。 由于蒙古人的幼子守灶的传统，漠北一带正是阿里不哥的地盘，忽必烈如果遵从惯例，估计是不可能活着做大汗的。 忽必烈事急从权，刚刚进入草原就不往前走了，在上都开了所谓的忽里台大会。

很多蒙古贵族都认为忽必烈这种做法违背祖制，拒绝承认这个大会的合法性，让忽必烈好生尴尬。 关键时刻，正是东道诸王的鼎力支持，才让忽必烈虽然名不正言不顺，但是好歹也坐上了大汗的位子。 不过，也正是由于这次不太合法的忽里台大会，蒙古汗国分裂了。

（忽必烈剧照）

忽必烈一系此后就被称为黄金家族，成吉思汗其他后代都不能算黄金家族。 元朝末年，就在中原部分的黄金家族融入了汉族，逃到漠北部分的黄金家族在瓦剌也先时“凡故元头目苗裔无不见杀”，使得黄金家族人丁寥落。 后来蒙古高原各部相攻，已经不认可黄金家族的统治地位。 直到蒙古达延汗时，曾经人丁兴旺的黄金家族，就只有这一根独苗了。

达延汗统一了蒙古各部，按照成吉思汗的做法，重新大行分封。 在扫平本部的叛乱之后，达延汗将从前各小领地合并为6个万户，仍分左、右两翼。 左翼3万户为:察哈尔万户(今锡林郭勒盟地区)、兀良哈万户(原卓索图盟地区)、喀尔喀万户(喀尔喀河流域一带);右翼3万户为:鄂尔多斯万户(今伊克昭盟一带)、蒙郭勒津万户(今大青山下土默特地区)、永邵布万户(今张家口以北一带)，汗廷设置在察哈尔境内。

这六万户除兀良哈万户以外，达延汗把其余五个万户都封给自己的儿子领有，这不但大大加强了大汗的集权地位，还使这些封地也成为蒙古人今后永远的归属。 长子图鲁博罗特早逝，其嫡裔世袭蒙古大汗汗位，并领有察哈尔万户；次子乌鲁斯博罗特在右翼谋反时被害，无嗣；三子巴尔斯博罗特任济农，领有右翼三万户；四子阿尔苏博罗特领有蒙郭勒津万户之七个鄂托克，称为土默特；五子阿勒楚博罗特内，受封居喀尔喀万户中喀尔喀河以东5个鄂托克，称为内喀尔喀；六子斡齐尔博罗特领有察哈尔万户之克什克腾鄂托克；七子格列博罗特领有察哈尔万户之敖汉和奈曼两个鄂托克；八子阿尔博罗特领有察哈尔万户之浩齐特鄂托克；九子格埒森扎，领有喀尔喀万户中喀尔喀河以西7个鄂托克，称为外喀尔喀；十子鄂卜衮锡青台吉领有永邵布万户之永邵布和阿苏特两鄂托克；十一子格术图无子，未分领地。

（达延汗中兴）

这样的格局一直到蒙古末代大汗林丹汗时，都没有太大的变化。 可是，随着时间的推移，这些蒙古贵族的亲戚们，或者因为草场，或者因为走失的牲畜，或者因为领到的明朝的赏赐，逐渐生出了很多嫌隙，彼此不够团结，难以形成强大的部落势力。 汗王的权力不断萎缩，直到蒙古各部自行其是，不再把中央汗王的号令当一回事，仅仅在名义上尊奉汗王。 在外蒙古的喀尔喀蒙古更是不承认蒙古大汗为共主，漠西蒙古卫拉特部则一直与蒙古帝国为敌。

蒙古帝国四分五裂的现状，使得林丹汗忧心不已。 可是东北地区的女真族又在努尔哈赤的带领下走向统一与强盛。 内忧外患之下的林丹汗，处境相当艰难。

林丹汗在即位十年后，逐渐坐稳了汗位，威望开始攀升。 他开始着力于振兴汗权。 他在赤峰地区兴建了都城，让他的那些桀骜不驯的亲戚们都来都城朝拜他，并且用图们汗法典约束他们。 本来加强集权的努力进行的还算可圈可点，可是林丹汗突然改变了信仰，由原来的黄教改成了红教。 喇嘛教是蒙古各部都信奉的宗教，多数人信奉黄教，因此林丹汗改宗这件事对于正在加强内部凝聚力无疑是一个很大的减分。

此后，林丹汗为了统一蒙古各部，不断征发他的那些亲戚们当兵打仗，还要求他们提供大量财物。 科尔沁草原一带的蒙古部落，开始引努尔哈赤为外援，逐渐不愿意听林丹汗的招呼。 林丹汗收到信息后很是震怒，因此发兵攻打科尔沁部，努尔哈赤带兵前来救援。 林丹汗料想打不过后金，就撤回来了。 此后，蒙古东部的部落都明目张胆地跟后金眉来眼去了。 皇太极即位后的第二年，趁着与袁崇焕达成和议的空档，带领与蒙古部落联军进攻林丹汗。 林丹汗没有办法，只好往西迁徙，扫平了右翼蒙古。 又过了几年，皇太极再次攻打林丹汗，林丹汗再次西逃，躲到了青海一带，并最终死在那里。

（最后的林丹汗）

皇太极料理完了蒙古地区的敌对势力，将整个北方都变成了后金的战略腹地，因此从容地从蒙古地区突入关内，大肆抢掠京畿地区。 蒙古各部也跟着皇太极出兵，抢到了不少明朝的财物，从此踏上了后金的战车，被编为蒙古八旗，成为满清的帮手。 满清极力拉拢蒙古各部，不仅娶了林丹汗的八位福晋，还与各部联姻，因此蒙古黄金家族的一些成员，也成为了满清宗室。

跟着后金（满清）能够抢大户，还能入主中原，捞个贵族当当；跟着林丹汗，却要与后金为敌，抢不到明朝的财物（林丹汗与明朝是战略盟友），还要被林丹汗管束，掠夺财物。 草原上不能再有一个成吉思汗，不然大家的草头王都当不成了。 清朝统治者给蒙古人划定了草场，封给了大量官爵，赏赐丰厚。 这明显的经济政治利益，根本无需仔细思考，他们自然愿意跟着后金（满清）了。