1、次级键secondarybond:除了典型的强化学键(共价键、离子键和金属键)等，依靠氢键以及弱的共价键和范德华作用力(即分子间作用力)相结合的各种分子内和分子间作用力的总称。

2、疏水键。 疏水键是多肽链上的某些氨基酸的疏水基团或疏水侧链（非极性侧链），由于避开水而造成相互接近、粘附聚集在一起。 它在维持蛋白质三级结构方面占有突出地位。

3、离子键。 指阴离子，阳离子间通过静电作用形成的化学键。 离子键属于化学键，大多数的盐，由碱金属或碱土金属形成的键，活泼金属氧化物都有离子键。 含有离子键的化合物称为离子化合物。 离子键与物体的熔沸点和硬度有关。

4、氢键。 氢原子与电负性大的原子X以共价键结合，若与电负性大、半径小的原子Y接近，在X与Y之间以氢为媒介，生成X-H…Y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键。